林毅夫于1979年5月16日游泳到厦门，叛逃中共；据林妻陈云英表态，林毅夫6月1日卸任世银职务后，想回台湾看看。
2002年林毅夫的父亲过世，他希望返台奔丧，当时台湾国防部强调，只要林毅夫返台，就必须面对军法调查；林毅夫共触犯至少五项刑事罪，最后他选择放弃，迄今未曾返台。
虽然，坊间有人呼吁人道立场考虑林毅夫状况，但许多台湾人认为林毅夫是在未被亏待且还被重用、并身为前线在役军官的情况下，投敌过于自私，枉顾国家培养与利益；许多人还因他的叛逃前程受到波及。
陆委会主委赖幸媛7日在立法院备询时表示，陆委会对在大陆长居人士返乡探亲不反对，但林毅夫是在服役期间叛逃，追诉期还没结束，国防部有特别考量并相当坚持，陆委会要尊重国防部。
亲民党立委张晓风表示，她不认为林毅夫的叛逃行为有任何可以“讲人情”的空间，林毅夫应该坦然面对司法，“才像一条汉子”。张晓风说，林毅夫叛逃事件，就算过了刑法追诉期，仍有民事责任，当年他把金门重要的军事机密带到中国，迫使政府改变金门军事部署，相关费用国防部应向林毅夫追讨。她指出，违法就是违法，林毅夫应该“好汉做事好汉当”。
林毅夫个人档案
林毅夫原名林正义，后因与部队长同名，又改名林正谊，1952年10月15日生于台湾宜兰县。幼时家境贫苦，母亲以洗衣谋生。1971年大学联考，考进国立台湾大学农学院农业工程系水利组。
林正义在就学于台湾大学期间，热衷学生运动。中华民国退出联合国时，林正义担任台湾大学一年级学生代表会的主席，他曾经在“反对共匪混入联合国”的座谈会上号召在联大开会前发动全国示威大游行，但建议未能成真。
1971年冬，大一上学期结束，赴成功岭寒训期间，向部队长官报告，决定要投笔从戎，不回台大念书。时值台湾退出联合国之际，他的行为成为青年报效国家、鼓舞士气的样板，一时之间成为台湾的风云人物。
因林正义为台湾籍、学习成绩佳，求学期间颇受蒋经国关照，以第二名成绩毕业于陆军官校，之后与政大陈云英结婚。他毕业后，不必立刻下部队，而以军职身份及国防公费的特权进入国立政治大学企业管理研究所就读，于1978年夏硕士毕业。
1978年12月，中共与美国签定建交公报，双方于1979年正式建交。1979年，中共国防部部长徐向前宣布，停止对金门持续20年的“单打双不打”炮击。
1979年2月16日，林正义成为金门防卫司令部284师马山连连长，军阶上尉。因马山与大陆角屿仅约2公里，只有最优秀的军官才能被分发至此。
1979年5月16日夜，从台湾探亲返回金门一周后，林正义身携军籍证明及机密资料，从金门泅海，投向中共人民解放军。
林毅夫叛逃大陆后，1982年取得北京大学政治经济学硕士，1986年取得芝加哥大学经济学博士，1993年升任北京大学教授，1994年与人共同创办北京大学中国经济研究中心并担任主任，2008年出任世界银行首席经济师兼主管发展经济学的资深副行长。
林毅夫也曾担任中共第七至第十届政协全国委员会委员。
大纪元记者钟元台北综合报导
