日本外务省则否认“召回大使”之举并非显示抗议中国，不过作为外交惯例大使“临时回国”常作为对抗措施使用。11日中国船只驶入日本领海后，日本外务省曾召见驻日大使程永华表示抗议，但12日又有中国船只驶入，外务省认为事态严重。
玄叶会见丹羽后承认，因尖阁诸岛问题上出现动向而要求其临时回国，并透露已指示丹羽准确传达日本的想法。他还表示会谈中没有谈及是否撤换丹羽一事。
据了解，丹羽汇报了野田政府拟将尖阁诸岛国有化的行为招致中国抗议的背景情况，并就日中邦交正常化40周年之际计划在中国举办的纪念活动交换了意见。
丹羽是历代驻华大使中在中国知名度最高的一位大使。上个月东京都知事表明购买钓鱼岛的计划后，丹羽曾提出反对意见，指如果实行的话，会给中日关系带来极大危机。大陆媒体则赞扬丹羽是一位有勇气讲出事实的日本人。
而另一方，日前有部分日本媒体猜测丹羽将因钓鱼岛言论失职，针对此，熟悉中国外交消息人士则分析说，，与以往以为敲打中方就会赢得选举的政治家不同，丹羽是一个会看大局有远见的人，如果他被撤换中日关系将进一步恶化。
而在中国大陆各媒体对本次事件进行高调报导，显示出对事件的强烈关注。其中《北京晚报》以及《法制晚报》均在头版报导了丹羽被召回国，并强调丹羽回国是汇报情况，很多中国人则认为是日方对中国渔船近日钓鱼岛海域所表示不快。
该报导还引用面向华侨的通讯社中国新闻专家分析事件时说，日本政府终于开始重视中方的反应了。而另一方在网络上则有更加强烈的留言，有指“中日关系已经到了即将开战的地步。”“中国也应该召回大使。”
玄叶一直强调“尖阁诸岛是日本固有领土，不存在主权问题”。以在野党为主的部分议员要求撤换丹羽，对此，玄叶予以否认。
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