据博讯2016年1月号报导，虽然这次军改的总体构思出自领导小组组长习近平本人，但方案则是先由多个部门同时草拟，最后由军改领导小组综合，并广泛征求意见后再定稿，因而最终的方案与最初的方案相比已有了很大的不同。
在各机构部门搞的军改方案初稿中，军科院的初稿被认为“最前卫”，“最美国化”。据称，外界传闻已久的“参谋长联席会议、国防部变文职机构、将战区降为军级”等，就来源于军科院的方案。
报导称，军科院的方案一出，军队内就炸了锅。不少将领指这个方案更像是一个“阴谋”。声称如果真的按这个方案实施，“军队一定会大乱的”。还有将领计算过，如果真的把战区降为军级，则意味着将有超过200将军下岗；未来5年内，将有5000多正值黄金年龄的军官被迫转业。
对此，有海外观察人士分析称，军科院初稿方案内容如果真的如传言所说的那样，那确实意味着要动到很多人的切身利益，所以受到很大的阻力也是在所难免的。习近平最终采取了较为折中稳健的方案，应该是为了减少一些不必要的阻力，顺利掌控军权，而在不影响大局的前提下，在人事安排上做了一些调整和让步。
事实上，自从2015年习近平在9月3日的大阅兵上宣布裁军30万后，北京当局就开始有计划地为军改预热。但从中共当局主动披露的消息来看，即使是在军改预热阶段，军队中的阻力就已经出现。
2015年10月底，中共军报接连发表6篇为军改造势的评论文章，对阻碍军改的势力严加警告，甚至指称，阻碍军改的势力在中高层军官中。
11月24日至26日，习近平当局在北京召开“中共中央军委改革工作会议”。会议上，习近平亲自向200多名军地高级官员公布了“全面实施改革强军战略”。习在讲话中直言，推进依法治军，要抓住“治权”这个关键。
随后，海外开始热传习近平在这次会议上放出的一句重话：“谁反对军改，就是反对军队进步，谁就下台！”
当时即有海外观察人士分析，习近平要真正实现对军队的全面控制，就必须彻底清除军中的江系腐败旧势力，也就是习提到的“治权”这个关键点。实际上，“治权”是为了“控权”，当年胡锦涛就是因为军权被徐才厚、郭伯雄架空，导致无所作为，习近平显然不愿意重蹈其覆辙。
来源:新唐人
